Il Museo Masaccio ha da sempre accompagnato le sue iniziative con la pubblicazione di fascicoli che documentassero restauri o nuove acquisizioni. Particolarmente importante è stata la pubblicazione del volume Masaccio 1422 dove sono raccolti numerosi saggi sul Trittico di San Giovenale sia dal punto d vista storico che iconografico, oltre a tutti i contributi di convegni e conferenze succedutisi dopo il ritorno dell’opera a Cascia nel 1988.
E’ entrata a far parte delle pubblicazioni del museo anche la guida Notizie diverse intorno alla pieve edita nel 2000 prima del’ apertura del museo e Il Madonnino di Santa Tea-Cronaca di un restauro dle 2010, dove si racconta il restauro di un importante manufatto cinquecentesco vicino alla pieve di Cascia.
Sulla linea della valorizzazione delle collezioni museali ma anche di quello del territorio Il museo ha iniziato nel 2018 la pubblicazione di una serie di piccoli fascicoli denominati I Quaderni del Museo Masaccio. Al momento sono due i Quaderni pubblicati , uno sul pittore Zanobi Rosi, il secondo su una antica croce medievale della chiesa di San Salvatore a Leccio.
